При Ученом совете Института организован Координационный совет - постоянно действующий консультативный орган, в задачи которого входит координационно-консультативное сопровождение научной и научно-организационной деятельности Института и его развития, прогнозирование результатов исследований, экспертиза научных трудов (в соответствии с Положением о координационном совете).
Председателем Координационного совета является заместитель заведующего лабораторией теоретической педагогики и философии образования, доктор педагогических наук, профессор Яков Семенович Турбовской. С 2015 по 2018 годы Председателем Координационного совета являлся академик РАО Евгений Викторович Ткаченко.
В состав Координационного совета входят ведущие ученые страны, академики и члены-корреспонденты Российской академии образования.
Структура Координационного совета представлена секторами, направленность которых определяется приоритетностью стратегических задач, решаемых Институтом. Оперативное руководство Координационным советом осуществляет его бюро, возглавляемое Председателем Координационного совета. В состав бюро входят заместители Председателя Координационного совета и руководители секторов.
К работе Координационного совета по подготовке и рассмотрению материалов, относящихся к его компетенции, привлекаются также сторонние научные и другие организации, а также отдельные ученые и специалисты в области педагогики и образования.
